1、前往合众地方！捷克罗姆的身影

2、艾莉丝与牙牙

3、水水獭！黑眼鳄！危在旦夕

4、对战俱乐部！神秘的神奇宝贝现身

5、三曜道馆 VS爆香猴、冷水猴、花椰猴

6、梦的遗址！食梦梦和梦梦蚀

7、藤藤蛇·迷人收服

8、火红不倒翁与达摩狒狒!钟塔的秘密

9、蜈蚣王发飙!救出牙牙

10、劲敌对战！强敌轻飘飘

11、石居蟹！取回自己的家吧

12、破破袋战队与秘密基地

13、泡沫栗鼠有洁癖

14、七宝市！博物馆大冒险

15、七宝道馆赛VS道馆训练家·芦荟

16、再次挑战七宝道馆！新绝招爆发

17、从蛋中孵出的小霸王

18、矢车森林！虫宝包与亚堤

19、酒侍对决！石居蟹VS双刃丸

20、皮卡丘VS黑眼鳄VS鸭宝宝

21、天之箭桥与歌德小姐

22、飞云市！百足蜈蚣恐慌

23、飞云道馆赛！纯情之心的虫系神奇宝贝对战

24、钓鱼酒侍！天桐登场

25、要小心可爱脸蛋！导电飞鼠电到发麻

26、导电飞鼠VS藤藤蛇！交换伏特大混乱

27、烛光灵大宅的恐怖故事

28、通往龙系大师之道！牙牙VS赤面龙

29、消失的扇贝贝！水水獭最大的危机

30、恋爱中的木棉球乘风飞翔

31、小灰怪与不明飞行物体

32、劲敌对战!迷你冰、搬运小匠参战

33、蓝蟾蜍、泥巴鱼！水边的战斗

34、龙之破坏者登场！艾莉丝与龙头地鼠

35、石丸子！发射光泽电炮吧

36、酒侍侦探天桐！差不多娃娃失踪事件

37、化石复活！古代怪鸟始祖大鸟

38、索罗亚电影！神奇宝贝骑士传说

39、全体集合！东·乔治对战

40、激战东·乔治对战！藤藤蛇VS驹刀小兵

41、白热化的东·乔治对战！导电飞鼠VS打击鬼

42、决战东·乔治对战！小智对艾莉丝

43、交涉喵·喵喵！头巾混混说服作战

44、要小心扒手猫！喵喵与水水獭

45、大宇怪与双卵细胞球与梦境小偷

46、交涉喵·喵喵！突破冻原熊的森林

47、疾奔！对战地下铁（前篇）

48、疾奔！对战地下铁（后篇）

49、道馆训练家是超级模特儿！小菊儿登场

50、雷文道馆！华丽的电击对战

51、小智、天桐对地下铁总控官

52、小智对冠军·阿戴克

53、前往彩虹另一头！街头沙铃的音乐剧

54、芽吹鹿！春夏秋冬全部到齐

55、滑头小子与任性的哥德宝宝

56、艾莉丝与单首龙!抚养屋修行

57、敏捷战士对几何雪男

58、天桐与伯特，兄弟对决！爆香猴VS花椰猴

59、龙卷云VS雷电云VS土地云（前篇）

60、龙卷云VS雷电云VS土地云（后篇）

61、地底的道馆赛！VS菊老大

62、电电虫、电蜘蛛！电石洞穴

63、通讯交换进化！骑士蜗牛和敏捷虫

64、黑英雄的遗迹！象征鸟与死神棺

65、二对二对战！皮卡丘·混混鳄VS蜈蚣王·蟾蜍王

66、爆爆头GO！爆爆头水牛NO

67、吹寄道馆的空想对战!挑战者天桐

68、吹寄道馆VS风露 空中决战

69、突破难关！登上天空之塔

70、东·乔治格斗大会开幕！滑头小子对花椰猿

71、不断继续吧东·乔治格斗大会！赤面龙对劈斩司令

72、激战东·乔治格斗大会！劈斩司令对炎武王

73、决战东·乔治格斗大会！投射鬼对打击鬼

74、救出牙牙！铁蚁的巢穴

75、罗斯山的激战！肋骨海龟的奇迹（前篇）

76、罗斯山的激战！肋骨海龟的奇迹（后篇）

77、炎之回忆！暖暖猪VS炎武王

78、哈奇库登场！火神虫的圣山

79、雪花道馆赛！冰之对战场地

80、神奇宝贝酒侍对决！品评对战

81、种子铁球研究所！艾莉丝与双倍多多冰

82、电影对决！合众防卫队 出击

83、激战立涌道馆VS霍米加（前篇）

84、激战立涌道馆VS霍米加（后篇）

85、歌唱吧，美洛耶塔爱的旋律

86、波加曼VS花椰猴

87、大岩蛇岛野外求生

88、酒侍侦探天桐！消失的喷嚏熊之谜

89、艾莉丝与小霸王快龙

90、青少年杯开幕！快龙对冻原熊

91、力量对决！艾莉丝对小光

92、小智、艾莉丝、修帝！最后的对决

93、道别与相遇的青少年杯

94、青海波道馆赛！巨翅飞鱼VS大剑鬼

95、神奇宝贝幼儿园大骚动！毛头小鹰与秃鹰小子

96、美洛耶塔与海底的神殿

97、灵兽型态合力进击！合众最大的危机

98、世界上第一华丽的神奇宝贝！奇诺栗鼠对藤藤蛇

99、天空和大地的双打对战

100、艾莉丝，回到龙之乡

101、双龙道馆，艾莉丝对夏卡

102、伊布队出动！神奇宝贝救援队

103、开幕！合众联盟·桧垣大会!小智对修帝

104、热斗！从劲敌对战中胜出

105、牙牙迷路走失了

106、打击鬼登场！小智对肯尼洋

107、小智对虎彻!秘密武器三头龙！

108、决战合众联盟！皮卡丘对路卡利欧

109、红豆杉研究所！展开新旅行

110、朋友……他的名字是N

111、新道馆训练家！黑连

112、阿克罗玛VS帅哥！电浆团的阴谋

113、雾之算木牧场！电龙的灯光！

114、N再度现身！拯救勇士鹰作战

115、紧急出动！神奇宝贝海岸救援队

116、燃烧吧！喷火龙VS快龙

117、电浆团的野心！被操纵的神奇宝贝

118、N的秘密…在雾的远方

119、火箭队对电浆团！喵喵与阿克罗玛

120、白色遗迹！小智对N

121、电浆团袭击！复活的仪式

122、雷希拉姆对N！理想和真实的那一方

123、再见了合众！新的乘船之旅

124、甘甜蜂蜜充满危险

125、酒侍侦探天桐！大海原的密室

126、再见水水獭！通往扇贝贝王之道

127、幻影之岛！雾中的索罗亚克

128、洛托姆VS大木博士

129、德科罗拉群岛的海贼王

130、小智与巴大蝴！直到再会的那一天

131、小智与艾莉丝绝交！离别的道路

132、向基拉祈许愿吧！七日间的奇迹

133、发光的飞碟！大宇怪之城

134、大堇登场，伞电蜥与坐骑山羊

135、宝藏之谜！无人岛冒险

136、小桩与艾莉丝！异色的赤面龙

137、音波飞龙登场！彗星与勇者的传说

138、前进吧！坐骑山羊

139、电飞鼠、加入火箭队

140、天桐VS冰之挑战者！三曜道馆的危机

141、超级愿望！直到再会的那一天

142、我的梦想、宝可梦大师

143、天桐与小刚！暴鲤龙的逆鳞

144、艾莉丝VS小椿！通往龙系大师之路

神奇宝贝第四部目录1：伊修地方！捷克罗姆的影子!(爱丽丝、修提、紫杉博士登场）（修提选择草藤蛇，皮卡丘被塞库罗姆的闪电击中无法使用电气系绝招） NO1.三曜市----水、草、火系道馆2：艾莉丝与牙牙!!（皮卡丘恢复正常，小智的旅行开始.爱丽丝加入，火箭队三人组的神奇宝贝寄放在本部（喵喵除外）（武藏收服到滚滚蝙蝠，小智收服到灰豆鸽）3：水水獭！黑目鳄！危机一发！！（小智收服到水水獭）4：对战俱乐部！迷之神奇宝贝登场！！(小智收服到暖暖猪） 5：三曜道馆VS火花猴 冷水猴 草叶猴！（田都登场）（小智挑战三曜道馆，使用暖暖猪，皮卡丘和水水獭出战。

）6：梦之迹地！梦娜与梦莎娜!!（小智得到三洋徽章，田都加入） （火箭队调查梦之遗迹，收集到三洋市未来能源的数据）NO2.七宝市-一般系道馆7：用颓废收服·草藤蛇!（小智收服藤藤蛇）8：达摩仔与达摩狒狒！时计塔的秘密！！ 9：暴走大角蜈蚣，拯救牙牙！10：劲敌对战，强敌普鲁水母！（小智VS修提）（火箭队侦探火石出场）11：寄岩蟹，返回自己的家（田都收服寄岩蟹）（火箭队收集到流星骑士的数据）12:破袋怪战队与秘密基地（小智得到宠物小精灵的蛋）13:奇拉米是洁癖！（贝儿登场，贝儿收服奇拉米，小智获得徽章盒）14.七宝市!博物馆大冒险!! （七宝市道馆训练家阿芦荟出场）15.七宝道馆赛!VS道馆训练家 阿芦荟!!(小智挑战七宝道馆落败，火箭队成功偷换陨石) 16.再战七宝道馆!新技炸裂!!（小智得到基本徽章，使用暖暖猪和水水獭出战。

）（暖暖猪学会了硝化冲锋，水水獭学会了水流喷射）NO3:飞云市-虫系道馆 17.从蛋孵出的野孩!(小智的神奇宝贝蛋孵化出奸诈蜥) 18.矢车森林!包衣蚕与雅技!